Yazar "Özmen Yelken, Besra" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim
    Öğe
    Comparative expression analysis of dasatinib and ponatinib-regulated lncRNAs in chronic myeloid leukemia and their network analysis
    (Humana Press Inc, 2022) Kayabaşı, Çağla; Caner, Ayşe; Yılmaz Susluer, Sunde; Balcı Okcanoglu, Tuğce; Özmen Yelken, Besra; Aşık, Aycan; Mutlu, Zeynep
    LncRNAs are associated with malignancies with their tumor suppressor/oncogenic properties. Although many studies are conducted related to the mechanism of action for dasatinib and ponatinib in chronic myeloid leukemia (CML), their comparative effects on lncRNA expressions are largely unknown. Hence, we aimed to define the lncRNAs involved in the treatment of CML with dasatinib and ponatinib. We measured the cytotoxicities of dasatinib/ponatinib with CCK-8 assay and identified differentially expressed lncRNAs (DEL) by qRT-PCR. We determined the principal functions of DELs by Ingenuity Pathway Analysis (IPA) and performed gene ontology (GO) analysis for apoptosis and anti-proliferation-related lncRNAs. Apoptotic and anti-proliferative activities of dasatinib/ponatinib were confirmed by flow-cytometry. In K562 cells, dasatinib/ponatinib re-regulated lncRNAs which were dysregulated in leukemia. DELs after treatment (forty with dasatinib, thirty-seven with ponatinib) were related to increased cell death; decreased cell viability, proliferation, tumor growth, invasion, migration. Dasatinib-mediated network was related to cancer, hematological disease while ponatinib-mediated network was associated with cancer, cell death/survival, cell-to-cell signaling/interaction. Both treatments predicted activation of IFN gamma, IL1 beta, TNF as upstream regulators, specially this effect was higher in dasatinib. Comparison analysis showed that ponatinib was predicted more effective in cell death of tumor cell line than dasatinib. We confirmed that ponatinib was more potent than dasatinib to induce apoptosis and inhibit proliferation of CML cells, in consensus with IPA and GO analysis results. LncRNAs are specifically involved in anti-leukemic activities of dasatinib and ponatinib. Our findings will contribute to understanding signalization occurring in CML cells after standard treatments.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Ponatinib ve Türkiye’de yetişen bazı endemik bitki ekstrelerinin kombinasyonlarının meme kanseri hücreleri üzerindeki etkileri
    (2022) Avcı, Çığır Biray; Süslüer, Sunde Yılmaz; Kurt, Cansu Çalışkan; Gündüz, Cumhur; Balcıokcanoğlu, Tuğçe; Kayabaşı, Çağla; Bağca, Bakiye Göker; Özmen Yelken, Besra
    Amaç: Meme kanseri, dünya genelinde kadınlarda en yaygın gözlenen malignansidir. Bu nedenle mevcut tedavilerin eksiklerini giderebilecek yeni stratejilerin tanımlanmasına ihtiyaç vardır. Çalışmamızda meme kanseri hücrelerinin hedeflenmesinde kullanılabilecek yeni bitkisel kombinasyon terapileri tanımlamayı hedefledik. Bu amaçla, Centaurea calolepis (CCİ), Origanum sipyleum (OSM) ve Phlomis lycia (PLİ) bitki ekstrelerinin ponatinib ile kombinasyonlarının MCF-7 hücreleri üzerindeki sitotoksik, apoptotik, anti-proliferatif ve hücre döngüsü üzerindeki etkileri araştırılmıştır. Gereç ve Yöntem: MCF-7 hücrelerinde OSM, CCİ, PLİ ve ponatinibin sitotoksik etkileri xCELLigence ile gerçek-zamanlı olarak ölçüldü. Ponatinib ile CCİ (p-CCİ), OSM (p-OSM), PLİ (p-PLİ) kombinasyonlarının analizleri için medyan-etki denklemini kullanıldı. Apoptoz, proliferasyon, hücre döngüsü düzenlenmesi akım sitometride değerlendirildi. Bulgular: MCF-7 hücrelerinde CCİ, OSM ve PLİ ekstrelerinin IC50 dozları sırasıyla 48. saatte 59,5, 57, 44,2 ?g/ml ve 72. saatte 51,6, 54,21, 42,52 ?g/ml olarak hesaplandı. Kombinasyon analizi sonuçlarına göre 48. saatte p-CCİ additif, p-OSM ve p-PLİ ılımlı sinerjistik etki sergilemekteydi. Ponatinib ile indüklenen apoptozun, CCİ ve PLİ kombinasyonlarıyla anlamlı düzeyde arttığı belirlendi. CCİ ve PLİ uygulamaları MCF-7 hücreleri üzerinde ılımlı düzeyde anti-proliferatif etki sergilerken, proliferasyonu en belirgin düzeyde OSM ekstresinin baskıladığı saptandı. Proliferasyon sonuçları ile uyumlu olarak, en yüksek G0/G1 tutulumu OSM uygulaması ile gözlendi. Kombine p-CCİ ve p-PLİ uygulamalarının ponatinibin anti-proliferatif etkisini anlamlı düzeyde arttırdıkları ve daha yüksek düzeyde G0/G1 birikimine neden oldukları ortaya koyuldu. Sonuç: Ponatinib ile CCİ, OSM, PLİ bitki ekstrelerinin kombinasyonları apoptozu indükleyerek, proliferasyonu baskılayarak ve hücre döngüsünün durdurarak meme kanserinde anti-kanser aktivitesi sergiledi. Belirlenen yüksek anti-kanser etkilerinin ışığında, Türkiye’de yetişen bu endemik bitki ekstreleri meme kanseri tedavisinde potansiyel strateji temsil edebilir.